Fundada en 1932 por 26 cooperativas convocadas por El Hogar Obrero (EHO), es la primera entidad de integración vertical del cooperativismo urbano argentino, y la primera federación del país en unirse a la Alianza Cooperativa Internacional en 1939.
Contando con el apoyo de EHO, la FACC desarrolló una amplia actividad que incluyó el aprovisionamiento de mercaderías a las cooperativas de consumo asociadas a ella, a través de su propio almacén mayorista (entre 1940 y 1979, y luego a través de los centros de distribución de EHO. Al mismo tiempo llevó a cabo una importante tarea de difusión de la doctrina cooperativa, comenzando con su Escuela de la Cooperación en 1938 y convirtiéndose a partir del mismo año en la primera editorial cooperativa del país. Entre otras, publicó la “Revista de la Cooperación” entre 1945 y 1982.
En 1985 la FACC contaba con 243 cooperativas asociadas, pero las sucesivas crisis económicas que padeció el país durante el último cuarto del siglo XX afectaron significativamente a un gran número de cooperativas de consumo, provocando la desaparición de muchas de ellas o su incorporación a El Hogar Obrero, reduciéndose consecuentemente el número de asociadas a la FACC, a 174 en 1991 y a solamente 127 en 1996. La grave crisis financiera y la posterior presentación en concurso preventivo de EHO, efectivizada en marzo de 1991, a lo que se sumó la caída de otras muchas pequeñas y medianas cooperativas que no resistieron la desalentadora situación económica, redujeron significativamente la operatoria del consumo cooperativo en el país y constituyeron un duro golpe a las actividades de la FACC, que encontró en la Cooperativa Obrera (Bahía Blanca) el principal sostén de su actividad, originando incluso que en el año 2008 trasladara su domicilio legal desde Buenos Aires a la ciudad de Bahía Blanca.
En 2015 fue aprobada una reforma del Estatuto de la FACC para admitir como asociadas a las entidades mutualistas en las que el consumo sea su actividad principal o secundaria. Actualmente la FACC tiene 121 entidades asociadas: cooperativas de consumo o con sección de consumo, y mutuales. Para fortalecer la integración económica entre cooperativas, en 2016 se creó la Central de Compras FACC (CCFACC), una central virtual que permite a las cooperativas y mutuales reducir costos, obtener mejores condiciones comerciales y, al mismo tiempo, fortalecer su integración con las cooperativas de trabajo y/o producción.